Het uitvoeren van microbiologisch lucht- en contactonderzoek is een specialisme. De wijze van bemonsteren, de te bemonsteren plaatsen, de gebruikte apparatuur en voedingsbodems hebben een grote invloed op de meetresultaten. Daarnaast vraagt het interpreteren van de meetresultaten expertise.

Om tot een uniforme werkwijze van het microbiologisch lucht- en contactonderzoek en beoordeling van de resultaten te komen, hebben de bij Binnenklimaat Nederland aangesloten binnenmilieu adviesbureaus dit meetprotocol opgesteld. Als basis van het meetprotocol dient de NEN-EN13098 (Blootstelling op de werkplek – Meting van micro-organismen en microbiële stoffen in de lucht - Algemene eisen).